| W ogrodach zoologicznych funkcjonuje Europejski Program Hodowli Gatunków Zagrożonych Wyginięciem EEP – (European Endangered Species Programme). Obecnie EEP obejmuje 279 gatunków zwierząt (34 gatunki w płockim ZOO). Ogrody zoologiczne ratują gatunki rzadkie i ginące. Nadzór nad wymianą zwierząt sprawują wysokiej klasy specjaliści w hodowli wybranego gatunku. Koordynatorzy odpowiadają za stan hodowli gatunków w europejskich ogrodach zoologicznych. Swoje decyzje podejmują na podstawie wytycznych Komisji EEP, która jest ich organem doradczym. ESB - (European Studbook) są dokumentami zawierającymi szczegółowe dane każdego indywidualnego osobnika. Są one niezbędne do zarządzania populacją. Księgi rodowodowe ESB prowadzone są dla 142 gatunków (19 gatunki w płockim ZOO).
 Gatunki płockiego Zoo objęte europejskimi programami hodowli EEP: 
	
		
			| SSAKI |  
			| Słoń indyjski | Elephas maximus | Asian elephant |  
			| Lwiatka złota | Leontophitecus rosalia rosalia | Golden lion tamarin |  
			| Miko czarny | Callimico goeldii | Goeldi's monkey |  
			| Tamaryna białoczuba | Saguinus oedipus | Cotton-top tamarin |  
			| Tamaryna cesarska | Saguinus imperator | Emperor tamarin |  
			| Tamaryna dwubarwna | Saguinus bicolor | Pied tamarin |  
			| Gibbon czapnik | Hylobates pileatus | Pileated gibbon |  |  
			| Pigmejka | Cebuella pygmaea | Pygmy marmoset |  
			| Lori mały | Nycticebus pygmaeus | Pygmy slow loris; Lesser slow loris |  
			| Tygrys syberyjski | Panthera tigris altaica | Siberian tiger |  
			| Pantera śnieżna | Panthera uncia | Snow leopard |  
			| Wilk grzywiasty | Chrysocyon brachyurus | Maned Wolf |  
			| Lampart perski | Panthera pardus saxicolor | Persian leaopard |  
			| Panda mała | Ailurus fulgens | Red panda |  
			| Osioł somalijski | Equus africanus somalicus | Somali wild ass |  
			| Zebra Hartmanna | Equus zebra hartmannae | Hartmann's mountain zebra |  
			| Żyrafa Rothschilda | Giraffa camelopardalis rothschildi | Baringo giraffe |  
			| Oryks szablorogi | Oryx dammah | Scimitar-horned oryx |  
			| Saki białolica | Pithecia pithecia | White-faced Saki |  
			| Tapir malajski | Tapirus indicus | Malayan Tapir |  
			| Galago senegalski | Galago senegalensis | Nothern galago |  
			| Lew | Panthera leo | African lion |  
			| Renifer leśny (fiński) | Rangifer tarandus fennicus | Finnish forest reindeer |  
			| Goral chiński | Naemorhedus griseus arnouxianus | Chinese Goral |  |  |  
			| PTAKI
 |  
			| Toko czarnoskrzydły | Tockus deckeni | Von der Decken's hornbill |  |  |  
			| Dzioborożec fałdodzioby | Rhyticeros undulatus | Wreathed hornbill |  |  |  
			| Szpak balijski | Leucopsar rothschildi | Rothschild's mynah |  
			| Kondor wielki | Vultur gryphus | Andean condor |  
			| Żuraw mandżurski | Grus japonensis | Red-crowned crane |  
			| Kiściec annamski | Lophura edwardsi | Edwards's pheasant |  
			| Orłosęp brodaty | Gypaetus barbatus | Bearded vulture |  
			| Ara szafirowa | Ara glaucogularis | Blue-throated macaw |  
			| GADY
 |  
			| Heloderma meksykańska | Heloderma horridum | Beaded lizard |  
			|  | Astrochelys radiata | Radiated tortoise |  
			|  |  |  |  
			| PŁAZY |  |  |  
			| Żaba gigant | Leptodactylus fallax | mountain chicken frog |   Gatunki płockiego ZOO, dla których prowadzone są europejskie księgi rodowodowe ESB:
 
	
		
			| SSAKI |  
			| Kangur rudy | Macropus rufus | Red Kangaroo |  
			| Foka szara | Halichoerus grypus | Grey Seal |  
			| Leniwiec dwupalczasty | Choloepus didactylus | Linne's Two-toed Sloth |  
			| Wielkomysz filipińska | Phloeomys pallidus | Northern Luzon giant cloud rat |    
	
		
			| PTAKI |  
			| Koroniec plamoczuby | Goura victoria | Victoria crowned pigeon |  
			| Ara zielona | Ara militaris mexicana | Mexican military macaw |  
			| Konura złota | Guaruba guarouba | Golden conure |  
			| Orłan (Bielik olbrzymi) | Haliaeetus pelagicus | Steller's sea eagle |  
			| Rybitwa peruwiańska | Larosterna inca | Inca Tern |  
			|  |  |  |  
			|  |  |  |  
			|  |  |  |    
	
		
			| GADY |  
			| Żółw olbrzymi | Heosemys grandis | Giant asian pond turtle |  
			| Orlicja | Orlitia borneensis | Malaysian giant pond turtle |  
			| Sanzinia madagaskarska | Sanzinia madagascariensis | Madagascar tree boa |  
			| Boa kubański | Epicrates angulifer | Cuban boa |  
			| Legwan wyspowy | Ctenosaura bakeri | Utila iguana |  
			|  |  |  |  
			|  |  |  |    
	
		
			| RYBY |  
			| Żarłacz rafowy czarnopłetwy | Carcharhinus melanopterus | Blacktip reef shark |  
			|  |  |  |  |